四世达赖喇嘛，阿拉坦汗曾孙。三世达赖圆寂时，西藏红教与黄教之间的斗争尚未结束。云丹嘉措（1589-1616），第四世达赖喇嘛。万历三十年（1602）被西藏三大寺代表迎回西藏，曾任哲蚌寺和色拉寺的法台。
云丹嘉措
人生经历索南嘉措去世后的第二年，即公元1589年，阿拉坦之孙苏弥尔的夫人(系成吉思汗弟哈撤尔十六世孙诺诺·卫征诺颜之女，名拜罕·珠拉)生育一子，很快就被蒙古王公和藏族格鲁派的僧人共同确认为是三世达赖索南嘉措的转世。接着，西藏格鲁派上层如三世达赖索南嘉措的管家班觉嘉措等也承认了这一认定，1592年班觉嘉措还到蒙古进行认定，并命名为云丹嘉措。1602年，云丹嘉措已十四岁，西藏三大寺派出正式代表前往土默特迎接他入藏。蒙古各王公也派人专程护送。云丹嘉措沿途受到青海、西藏的蒙藏僧俗人众迎接，于1603年到达西藏，先在藏北热振寺举行了坐床典礼，后到拉萨，住进哲蚌寺，拜噶丹寺赤巴根敦坚赞为师，举行出家仪式，受沙弥戒。
1607年，云丹嘉措赴扎什伦布寺，向四世班禅罗桑却吉坚赞学法，两个人相处感情甚洽。云丹嘉措在扎什伦布寺住了一个时期才回到拉萨。1614年，云丹嘉措请四世班禅到哲蚌寺，拜四世班禅为师，受了比丘戒。接着云丹嘉措应哲蚌寺憎众之请，继任了哲蚌寺第十三任赤巴，又应色拉寺僧众之请，兼任了色拉寺第十五任赤巴。1616年，明朝万历皇帝派专人进藏，给予四世达赖喇嘛“普持金刚佛”的封号和封文(见《西藏中世纪史》99页)。这是明朝对三世达赖喇嘛封号的延续。
1616年12月15日，第四世达赖喇嘛云丹嘉措在哲蚌寺突然去世，时年二十八岁。
对云丹嘉措之死，有人说是藏巴汗彭措南杰派人刺死的。因为藏巴汗得了病，据说是四世达赖云丹嘉措对他进行了诅咒所致；被藏巴汗察觉，于是派人刺死云丹嘉措。这只是一种传说，无有确凿的事实。但当时西藏政局发生了很大的变化，后藏地区完全落入藏巴汗的控制，而藏巴汗对黄教采取敌对态度，则是事实。云丹嘉措的死，反映了当时西藏封建领主之间的权力斗争。
云丹嘉措去世后，按照格鲁派规矩，须寻找转世灵童。“当时藏巴汗疑达赖诅咒，致感多病，即明令不许达赖转世，经班禅罗桑却吉坚赞一再要求，始准寻觅五世达赖灵童。”
出生后先由土默特部王公贵族及三世达赖喇嘛的管家楚臣嘉措等认为是三世达赖喇嘛索南嘉措的转世灵童，由班觉嘉措写信给西藏，叙述他的灵异情状，请求派代表前来查访。西藏方面接信后即停止了在西藏地区的灵童寻访工作。
明万历二十年(1592)西藏派出索南嘉措的强佐贝丹嘉措及帕木竹巴政权首领的代表等人率甘丹、哲蚌、色拉三大寺僧众代表前去蒙古核查及迎请，临行时卸任甘丹赤巴班觉嘉措以格鲁派年龄最大的僧人的名义，给灵童起名为云丹嘉措，表明已经确认了灵童的地位。
他被迎请到呼和浩特时，由于父母不愿儿子远离，所以他在呼和浩特滞留达10年之久。
三十年(1602)他在西藏代表团及蒙古骑兵护送下，经宁夏、甘肃、青海入藏，次年到达拉萨，在热振寺举行坐床典礼，然后到哲蚌寺居住学经。
三十三年(1605)以甘丹赤巴桑结仁钦、根敦坚赞为师受沙弥戒。桑结仁钦因自己年老体弱，为他延请扎什伦布寺住持罗桑确吉坚赞(四世班禅大师)来拉萨给他讲经传法，并和他一起步行去曲科杰寺朝礼。他多次到前后藏各地云游，对当时处境困难的格鲁派起子重要的稳定作用。
四十二年(1614)以四世班禅罗桑确吉坚赞为师受比丘戒，这是达赖喇嘛和班禅活佛系统之间互相传戒的开始。他出任哲蚌寺第十三任法台，兼任色拉寺第十五任法台。
四十四年(1616)明朝派人入藏，封他为“普持金刚佛”，并赐给官服、印章等，还邀请他进京朝见。他未及成行即于当年十二月在哲蚌寺圆寂。
大事年表云丹嘉措
四世达赖喇嘛云丹嘉措于公元1589年即藏历第十饶迥的土牛年出生在蒙古地方，其父名辰曲库尔，出身于成吉思汗后裔的家族。他出生时有许多的征相和异兆，在外面广为流传。当时，正寻找索南嘉措的转世，护法和上师都说转世将在蒙古地方出现，于是派遣索南嘉措的索本(掌管饮食的侍从)楚臣嘉措到蒙古各处仔细寻访。楚臣嘉措将辰曲库尔的儿子是索南嘉措的真实无误的转世的情况，派遣信使到西藏报告。公元1592年即藏历第十饶迥的水龙年云丹嘉措3岁时，被确认为索南嘉措的转世。西藏方面派遣高级侍从前去蒙古向灵童奉献礼品，在他们动身时，卸任甘丹赤巴杰康孜巴班觉嘉措给灵童取名字为“遍知一切云丹嘉措贝桑布。”并给云丹嘉措捎去了礼物。使者们虽然努力争取尽快迎请灵童到西藏，但是由于父母亲对儿子十分疼爱，几次推迟了行期，因此云丹嘉措在蒙古地方一直生活到他14岁，公元1603年即藏历第十饶迥水兔年，14岁的云丹嘉措到达西藏，登上哲蚌寺甘丹颇章的宝座。然后他到大昭寺，在觉卧释迦牟尼像前，由甘丹赤巴给他传授了沙弥戒。此后不久，班禅洛桑却吉坚赞从扎什伦布寺前来会见了云丹嘉措，并在前藏居住数年，给云丹嘉措讲授了许多显密教法。此后云丹嘉措主持了拉萨祈愿大法会。此后云丹嘉措经过尼木、吞巴等地前往扎什伦布寺，此时噶玛巴一方与格鲁派之间的矛盾激化，但是第悉藏巴噶玛彭措南杰还是向云丹喜措献了食品柴禾等资具，后藏地区的僧人俗民众前来拜见云丹嘉措。
云丹嘉措返回前藏途中又巡礼了江孜的白居寺、乃宁寺。他在乃宁寺居住时，因对第悉藏巴噶玛丹迥旺波在后藏支持噶玛巴迫害格鲁派，并派遣后藏军队进兵吉雪(拉萨河下游)不满，在甲职强钦波(大咒师)的灵塔跟前，呼叫第悉藏巴和臣僚们的名字进行诅咒法事。
公元1614年即藏历第十饶迥的木虎年，云丹喜措26岁，班禅洛桑却吉坚赞给他授了比丘戒。明朝万历皇帝派遣喇嘛索南洛追等使者前来邀请云丹嘉措，并封给他“恰达多吉桑结”(遍主金刚佛)的称号，赐给官帽、官服及印章等，邀请云丹嘉措前往祖国内地。但是云丹嘉措未能成行，在他28岁的公元1616年即藏历第十饶迥的龙年圆寂。云丹嘉措的遗体被火化，据说从心、舌、眼三处及头盖骨上出现了许多舍利。头盖骨和心脏被作为信奉物迎往蒙古地方。用云丹嘉措的舍利等物品装藏，建造了银质灵塔，供奉在哲蚌寺中。[2]
注释①大威德金刚：亦称怖畏金刚、牛头明王、系藏传佛教格鲁派修习的密宗本尊之一，被认为是无量寿佛的化身。佛像为人身牛面，头顶有光焰，足踏一人，呈忿怒相，以其可怖可畏教令法界，镇伏妖魔。
②登松、白格尔：是桑耶寺的护法神，自莲花生建立桑耶寺起，就尊崇这些据说是苯教的古老神祇。又据说四世达赖云丹嘉措为避藏巴汗之乱，曾短期离开拉萨到桑耶寺避过难，他曾祈愿这些护法神祇的庇佑。
③贡乔群培：著名大喇嘛，曾是五世达赖罗桑嘉措幼年时的上师和监护人，出身雅郊家族，生卒年为1575--1644年，享年72岁。五世达赖曾著有关于他的简传。
