ITS鉴定的ITS鉴定的原理
rDNA 上的5 .8 、18 和28 SrRNA 基因有极大的保守性, 即存在着广泛的异种同源性。而由于ITS 区不加入成熟核糖体, 所以ITS 片段在进化过程中承受的自然选择压力非常小,因此能容忍更多的变异。在绝大多数的真核生物中表现出了极为广泛的序列多态性, 即使是亲缘关系非常接近的2 个种都能在ITS 序列上表现出差异, 显示最近的进化特征。研究表明,ITS 片段的进化速率是18 S rDNA 的10 倍。这就是ITS 序列在微生物种类鉴定和群落分析的理论基础。ITS1 和ITS2 是中度保守区域, 其保守性基本上表现为种内相对一致, 种间差异比较明显。这种特点使ITS 适合于真菌物种的分子鉴定以及属内物种间或种内差异较明显的菌群间的系统发育关系分析。由于ITS 的序列分析能实质性地反映出属间、种间以及菌株间的碱基对差异, 此外ITS 序列片段较小、易于分析, 目前已被广泛应用于真菌属内不同种间或近似属间的系统发育研究中。ITS 的序列分析还有效地解决Lenti nul a 、Suill us 、Tuber 、Cer at ocystis 和Oi diodendron等真菌应用形态学特征进行分类所引起的纷争, 弥补了传统分类上的一些不足。
[create_time]2017-09-26 14:56:29[/create_time]2016-06-15 10:00:24[finished_time]1[reply_count]2[alue_good]红茶_儽理[uname]https://himg.bdimg.com/sys/portrait/item/wise.1.f661b57c.CCIZA_XRUYbM0thEpsPJ1w.jpg?time=3678&tieba_portrait_time=3678[avatar]TA获得超过131个赞[slogan]这个人很懒，什么都没留下![intro]906[view_count]its序列的介绍
在 rDNA 基因中，5.8S rDNA 和 28S rDNA 基因间隔序列称为（ITS），它的长度和序列变化较大，将其扩增物进行 RFLP 或序列分析，可用于对真菌的不同生物型、菌株、种、属进行分类鉴定。甚至用于区分关系非常近的种。
[create_time]2016-05-28 16:33:21[/create_time]2016-06-08 10:57:03[finished_time]1[reply_count]3[alue_good]永音不2271[uname]https://himg.bdimg.com/sys/portrait/item/wise.1.bb9d0e6c.dLyuSlC_BPzWjYhR0fUx8Q.jpg?time=4958&tieba_portrait_time=4958[avatar]TA获得超过443个赞[slogan]这个人很懒，什么都没留下![intro]1013[view_count]ITS序列分析的应用原理和主要步骤有哪些
我正好也在做这个诶~
原理：rDNA中18S、5.8S与26S的基因序列在真核生物中高度保守,而ITS承受的选择压力较小,相对进化速度较快,具有很高的可变性,且在核基因组中高度重复,这样可以根据保守序列中的变异位点设计特殊引物对ITS区进行PCR扩增。ITS区的可变性为物种鉴定提供了丰富的变异位点和信息位点,对ITS区进行PCR扩增、测序及序列分析后再设计特异引物,来诊断和检测植物病原菌以及植物类群等,已得到越来越广泛的应用。通过ITS序列的分析，还可以判断很多属、种之间的亲缘关系。
主要步骤：首先是提取基因组DNA，然后通过引物扩增ITS序列，对于效果好的进行测序，测得的序列在用软件进行分析
[create_time]2012-06-05 09:46:52[/create_time]2012-06-11 18:04:15[finished_time]1[reply_count]3[alue_good]zihuanyuyu[uname]https://himg.bdimg.com/sys/portrait/item/wise.1.142cef8c.p7JQ_Sf-Ofwtdo_McQgPoQ.jpg?time=2914&tieba_portrait_time=2914[avatar]超过12用户采纳过TA的回答[slogan]这个人很懒，什么都没留下![intro]2846[view_count]
ITS序列分析的应用原理和主要步骤有哪些
聚合酶链式反应（Polymerase Chain Reaction，PCR）是体外酶促合成特异DNA片段的一种方法，为最常用的分子生物学技术之一。典型的PCR由（1）高温变性模板；（2）引物与模板退火；（3）引物沿模板延伸三步反应组成一个循环，通过多次循环反应，使目的DNA得以迅速扩增。其主要步骤是：将待扩增的模板DNA置高温下（通常为93℃-94℃）使其变性解成单链；人工合成的两个寡核苷酸引物在其合适的复性温度下分别与目的基因两侧的两条单链互补结合，两个引物在模板上结合的位置决定了扩增片段的长短；耐热的DNA聚合酶（Taq酶）在72℃将单核苷酸从引物的3’端开始掺入，以目的基因为模板从5’→3’方向延伸，合成DNA的新互补链。 PCR能快速特异扩增任何已知目的基因或DNA片段，并能轻易在皮克（pg）水平起始DNA混合物中的目的基因扩增达到纳克、微克、毫克级的特异性DNA片段。因此，PCR技术一经问世就被迅速而广泛地用于分子生物学的各个领域。它不仅可以用于基因的分离、克隆和核苷酸序列分析，还可以用于突变体和重组体的构建，基因表达调控的研究，基因多态性的分析，遗传病和传染病的诊断，肿瘤机制的探索，法医鉴定等诸多方面。通常，PCR在分子克隆和DNA分析中有着以下多种用途： (1) 生成双链DNA中的特异序列作为探针； (2) 由少量mRNA生成 cDNA文库； (3) 从cDNA中克隆某些基因； (4) 生成大量DNA以进行序列测定； (5) 突变的分析； (6) 染色体步移； (7) RAPD、AFLP、RFLP等DNA多态性分析等。
[create_time]2017-10-15 16:11:04[/create_time]2017-10-30 16:09:54[finished_time]1[reply_count]1[alue_good]jt...c@mail.ru[uname]https://himg.bdimg.com/sys/portrait/item/wise.1.a3a8ba18.OojIgKmDvKgImvUZjiG5Lw.jpg?time=8333&tieba_portrait_time=8333[avatar][slogan]这个人很懒，什么都没留下![intro]314[view_count]
菌种鉴定的方法
首先你要确定待鉴定的菌种一定是纯种 。如果菌种不纯，所观察到的现象则是混合现象，这样自然不会得到正确的结果。因此在鉴定之前，首先要将菌种纯化。 纯化方法，一般有2种：平板划线单菌落分离法和单细胞分离法。前一种操作简便，效果良好，适用范围广。
菌种鉴定的方法一般有常规鉴定和分子生物学方法：
（1）常规鉴定：菌落形态观察、革兰氏染色、菌毛染色、糖类分解实验、吲哚实验、淀粉水解实验、V-P实验、甲基红实验、柠檬酸盐利用实验、硝酸盐还原实验、接触酶实验等
（2）分子生物学方法：细菌16SrDNA菌种鉴定：提取DNA，特定引物PCR扩增，PCR产物纯化测序，进化树分析；真菌18S rDNA/ITS菌种鉴定流程也是一样的。
[create_time]2018-07-18 05:42:50[/create_time]2013-03-04 10:03:00[finished_time]2[reply_count]21[alue_good]须诺Rf[uname]https://himg.bdimg.com/sys/portrait/item/wise.1.75306122.7eI7zyjymljVwtrORejSSA.jpg?time=3441&tieba_portrait_time=3441[avatar]TA获得超过357个赞[slogan]这个人很懒，什么都没留下![intro]19315[view_count]
ITS鉴定的ITS 鉴定的方法学
真菌rDNA ITS 序列分析用于真菌系统分类通常通过多聚酶链式反应( PCR) 技术实现。rDNA 多复制的特性, 有利于低浓度或被更高度降解的DNA 样品中ITS区域的扩增。这有利于研究尚无任何rDNA 序列资料的生物。根据这些基因上高度保守区段设计出通用引物, 借助PCR 技术扩增rDNA 的目的片段。PCR 技术在真菌分类、鉴定中与直接测序法相结合有很大的优越性[ 14] : ①只需少量的DNA, 每次扩增只需约0 . 1 ～10 ng ; ②可对DNA 的2 条链测序, 从而减少错误; ③可利用总DNA 的较粗制备品; ④适合于自动测序仪进行测序。
[create_time]2016-05-31 11:20:12[/create_time]2016-06-15 10:00:24[finished_time]1[reply_count]0[alue_good]浣熊103[uname]https://himg.bdimg.com/sys/portrait/item/wise.1.d95e10a8.v2XhAwZOT-mVomI2HlnAVQ.jpg?time=3632&tieba_portrait_time=3632[avatar]TA获得超过102个赞[slogan]这个人很懒，什么都没留下![intro]474[view_count]ITS序列分析的应用原理和主要步骤有哪些
我正好也在做这个诶~
原理：rDNA中18S、5.8S与26S的基因序列在真核生物中高度保守,而ITS承受的选择压力较小,相对进化速度较快,具有很高的可变性,且在核基因组中高度重复,这样可以根据保守序列中的变异位点设计特殊引物对ITS区进行PCR扩增.ITS区的可变性为物种鉴定提供了丰富的变异位点和信息位点,对ITS区进行PCR扩增、测序及序列分析后再设计特异引物,来诊断和检测植物病原菌以及植物类群等,已得到越来越广泛的应用.通过ITS序列的分析,还可以判断很多属、种之间的亲缘关系.
主要步骤：首先是提取基因组DNA,然后通过引物扩增ITS序列,对于效果好的进行测序,测得的序列在用软件进行分析
[create_time]2022-07-12 19:47:40[/create_time]2022-07-22 13:57:43[finished_time]1[reply_count]0[alue_good]清宁时光17[uname]https://himg.bdimg.com/sys/portrait/item/wise.1.f66817d0.sg2uptlA4rVTuV_qaAgZJw.jpg?time=582&tieba_portrait_time=582[avatar]TA获得超过1.1万个赞[slogan]这个人很懒，什么都没留下![intro]267[view_count]
