50余年来，学校学位与研究生教育事业得到了长足的发展。共招收硕士研究生12000余人，博士研究生3600余人，培养了我国第一个农学博士，第一个果树学博士，第一个农业工程硕士。在校研究生人数达6000余人。
党的“十五大”以来，学校研究生教育坚持“强校之路”的战略发展定位，坚持“以发展为主题，以研究生培养质量为根本和生命线，外抓机遇求发展，内抓规范求质量”的工作思路，各项事业取得了很大的发展。现有国家重点学科8个，博士学位授权一级学科10个、博士学位授权二级学科54个，硕士学位授权一级学科15个、硕士学位授权二级学科87个，博士后科研流动站7个。同时在农业推广硕士、兽医硕士、工程硕士、风景园林硕士、工商管理硕士、社会工作硕士等6种专业学位招收全日制和在职研究生，学位与研究生教育覆盖文学、法学、经济学、管理学、理学、工学、农学等7大学科门类。
2011年12月22日，研究生处正式更命为研究生院。
师资力量现有教职工2600多人，其中教师1569人，教授340人。有中国科学院院士1人，中国工程院院士4人，美国科学院外籍院士1人，第三世界科学院院士2人，专家20人，万人计划专家4人，长江学者23人，国家杰青19人，973计划首席科学家6人，现代农业产业技术体系首席科学家1人、岗位科学家39人。国家自然科学基金创新研究群体3个，省部级优秀创新团队38个。国家级教学名师4人，国家教学团队7个。累计获国家级教学成果奖22项，其中特等奖1项、一等奖3项、二等奖18项。“十二五”期间，获批国家教育体制改革项目1项、国家专业综合改革试点专业2个、国家“卓越工程师教育培训计划”专业2个、国家“卓越农林人才教育培养计划”专业8个、国家级实验教学示范中心4个、国家级大学生校外实践基地10个、教育部农业部农科教合作人才培养基地6个、国家级精品资源共享课32门、国家级精品视频公开课10门、国家级“十二五”规划教材18种。
学科建设重点学科华中农业大学作为国家教育部直属大学，有作物遗传育种、作物栽培学与耕作学、微生物学、果树学、分子化学与分子生物学、动物遗传育种、水产养殖、农业经济管理等8个国家级重点学科，有园林植物与观赏园艺、生物化学与分子生物学、动物遗传育种与繁殖、农产品加工及贮藏工程等4个部级重点学科，生物学、食品科学、园艺学、农业资源利用、植物保护、动物营养与饲料科学、兽医学、园林植物与观赏园艺、水产、农林经济管理、土地资源管理等11个省级重点学科（涵盖二级学科32个），产业经济学、森林培育、企业管理、食品科学、发酵工程、基础兽医学等6个校级重点学科。在2012年全国第三轮一级学科评估中，6个学科名列同类学科前三位。其中，园艺学第1，畜牧学、兽医学第2，作物学、水产、农林经济管理第3，农业资源与环境第5，植物保护第7，生物学第8（排名率进入前10%），食品科学与工程第10（排名率进入前20%）。农业科学、植物与动物学、化学、生物学与生物化学、分子生物学与遗传学五个学科领域进入ESI国际同类学科领域前1%。
博士后流动站华中农业大学现有博士后流动站10个，分别为作
物学流动站
、植物保护流动站
、生物学流动站
、食品科学与工程流动站
、园艺学流动站
、农业资源利用流动站、农林经济管理流动站
、畜牧学流动站
、兽医学流动站
、水产流动站
。博士点华中农业大学现有博士学位授予权专业54个，其中自主设置的博士学位授予权专业13个，覆盖了经济学、法学、理学、工学、农学、管理学6大学科门类。
硕士点华中农业大学始建于1898年，是我国办学历史最久的农林高等院校，1953年开始研究生教育；是首批获得博士学位和硕士学位授予权的学校之一。现有10个博士后科研流动站、13个博士学位授权一级学科、54个博士学位授权专业、87个硕士学位授权专业，覆盖了经济学、法学、理学、工学、农学、管理学6大学科门类。每年拟招收学术性学位研究生1500余人；同时招收在职人员攻读硕士学位，拥有农业推广硕士、兽医硕士和工程硕士等三种类型专业学位以及高校教师攻读硕士学位招生权限。雄厚的师资力量、充足的科研经费、浓郁的学术氛围、规范的教育管理，为研究生营造了理想的科研和学习园地。
科学研究科研项目目前学校承担的各类在研科技项目1434项，其中国家科技攻关计划、“863”计划、“973”计划、“948”计划、国家转基因植物专项、国家自然科学基金项目等378多项，国际合作项目近46项，部、省级项目530项。
成果与专利“十五”以来，获得省部级以上科技成果奖109项；获得授权专利53项；推广各类科研成果和适用技术150多项。在杂交油菜、绿色水稻、优质种猪、动物疫苗、优质柑橘、试管种薯等研究领域，取得了被媒体誉为“华中农业大学六个一”（一枝花、一株稻、一头猪、一支苗、一棵树、一粒豆）的标志性成果。[1]
科研基地学校建有国家级、省部级研发基地29个，其中：
国家重点实验室
（2个）作物遗传改良国家重点实验室农业微生物学国家重点实验室国家专业实验室（1个）国家兽药残留基准实验室
国家工程（技术）研究中心（
3个）微生物农药国家工程研究中心 国家家畜工程技术研究中心 国家油菜工程技术研究中心国家育种中心
（6个）国家植物基因研究中心（武汉）国家柑橘育种中心 国家农作物分子技术育种中心 国家果树脱毒种质资源室内保存中心 国家油菜武汉改良分中心 国家蔬菜改良中心华中分中心 教育部重点实验室（2个）园艺植物生物学教育部重点实验室 农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室农业部重点实验室
（3个）农业部猪遗传育种重点开放实验室农 业部食品安全评价重点开放实验室 农业部亚热带农业资源与环境重点开放实验室湖北省重点实验室
（2个）湖北省预防兽医学重点实验室 湖北省作物病害监测和安全控制重点实验室省部研究中心
（7个）湖北省柑桔工程技术研究中心 湖北省马铃薯工程技术研究中心 教育部油菜工程研究中心 国家农产品加工技术研发淡水鱼类专业分中心 动物生物药物教育部工程研究中心 湖北农村发展研究中心 湖北省动物疫苗工程技术研究中心省部级质量检测中心
（3个）农业部种猪质量监督检验测试中心（武汉）农业部微生物产品质量监督检验测试中心（武汉）湖北省饲料质量监督检验站校级研究中心与实验室
