陈义华

时间:2023-11-13 15:09:52编辑:莆田seo君
基本信息

陈义华

学习经历

1994年9月-1998年6月 南京农业大学,大学本科

1998年9月-2001年6月 南京农业大学,硕士研究生

2001年9月-2005年7月 中国科学院微生物研究所,博士研究生

工作经历

2006年7月-2011年4月 美国威斯康星大学—麦迪逊分校 (UW-Madison),博士后、研究助理(Postdoc Research Associate)

2011年4月- 中国科学院微生物研究所,研究员

研究方向

主要从事微生物天然产物资源的开发和生物合成机理的研究。

微生物次级代谢的研究。以放线菌为主要研究对象,致力于运用分子遗传学、生物化学、化学和生物信息学的综合手段来研究微生物来源的活性次级代谢产物。解析它们的合成机理和生物学功能,寻找新的代谢机理和具有良好生物活性的新化合物。希望在对这些具有实用价值的活性分子的生物合成充分了解的基础上,设计合理的工程策略,改造目标分子。同时尝试利用基因组发掘(Genome mining)的方法得到新的微生物次级产物。

研究内容及意义

微生物天然产物是药用小分子、食品添加剂等的重要来源之一。关于微生物天然产物的研究对现代人生活和健康状况的改善起了极大的推动作用。本实验室致力于运用分子遗传学、生物化学、化学和生物信息学的综合手段来研究微生物生产的具有实用价值的生物活性分子。主要包括以下两个方面的研究内容:

(1)选择有实用价值的微生物来源的活性分子,利用不同的手段研究其生物合成机理。在对微生物来源活性分子的生物合成机理充分了解的基础上,设计合理的工程策略,改造目标分子。

(2)微生物的全基因组测序揭示,远远超过已知化合物数量的天然产物合成基因簇存在于微生物基因组中。希望利用新发展的基因组学手段,探索微生物生产天然产物的潜力,并选择特定的菌种或特殊类型的化合物,尝试利用基因组发掘的方法得到新的活性分子。

代表论著

·Yihua Chen, Min Yin, Geoff P. Horsman, and Ben Shen. (2011) Improvement of the Enediyne Antitumor Antibiotic C-1027 Production by Manipulating Its Biosynthetic Pathway Regulation in Streptomyces globisporus. Journal of Natural Products 74: 420-424.

·Yihua Chen, Evelyn Wendt-Pienkowski, Jianhua Ju, Shuangjun Lin, Scott R. Rajski, and Ben Shen. (2010) Characterization of FdmV as an amide synthetase for fredericamycin A biosynthesis in Streptomyces griseus ATCC 43944. The Journal of Biological Chemistry 285: 38853-38860.

·Geoff P. Horsman*, Yihua Chen*, Jon S. Thorson, and Ben Shen. (2010) Polyketide synthase chemistry does not direct biosynthetic divergence between 9- and 10-membered enediynes. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 107: 11331-11335 (*co-first author)

·Yihua Chen, Min Yin, Geoff P. Horsman, Shengxiong Huang, and Ben Shen. (2010) Manipulation of pathway regulation in Streptomyces globisporus for overproduction of the enediyne antitumor antibiotic C-1027. The Journal of Antibiotics 63: 482-485.

·Yihua Chen*, Keqiang Fan*, Yongzhi He, Xinping Xu, Yanfeng Peng, Tingting Yu, Cuijuan Jia and Keqian Yang. (2010) Characterization of JadH as an FAD- and NAD(P)H-dependent bifunctional hydroxylase/dehydrase involved in jadomycin biosynthesis. ChemBioChem. 11: 1055-1060. (*co-first author)

·Yihua Chen, Micheal J Smanski, and Ben Shen. (2010) Improvement of secondary metabolite production in Streptomyces by manipulating pathway regulation. Applied Microbiology and Biotechnology 86: 19-25.

·Yihua Chen, Evelyn Wendt-Pienkoski, Scott R. Rajski, and Ben Shen (2009) In vivo investigation of the roles of FdmM and FdmM1 in fredericamycin biosynthesis unveiling a new family of oxygenases. The Journal of Biological Chemistry 284: 24735-24743.

·Yihua Chen, Evelyn Wendt-Pienkowski, and Ben Shen (2008) Identification and utility of FdmR1 as a Streptomyces antibiotic regulatory protein activator for fredericamycin production in Streptomyces griseus ATCC 49344 and heterologous hosts. Journal of Bacteriology 190: 5587-5596.

·Yihua Chen, Yinggang Luo, Jianhua Ju, Evelyn Wendt-Pienkowski, Scott R. Rajski, and Ben Shen. (2008) Identification of fredericamycin E from Streptomyces griseus: insights into fredericamycin A biosynthesis highlighting carbaspirocycle formation. Journal of Natural Products 71: 431-437.

·Yi-hua Chen, Chen-chen Wang, Lisa Greenwell, Uwe Rix, Dirk Hoffmeister, Leo C. Vining, Jürgen Rohr, and Ke-qian Yang (2005) Functional analyses of oxygenases in jadomycin biosynthesis and identification of JadH as a bifunctional oxygenase/dehydrase. The Journal of Biological Chemistry 280: 22508-22514.

·Xiang-Jing Wang, Yi-Jun Yan, Bo Zhang, Jing An, Ji-Jia Wang, Jun Tian, Ling Jiang, Yi-Hua Chen, et al. and Wen-Sheng Xiang (2010) Genome Sequence of the Milbemycins-producing Bacterium Streptomyces bingchenggensis. Journal of Bacteriology 192: 4526-4527.

·Shuangjun Lin, Geoffrey P. Horsman, Yihua Chen, Wenli Li, and Ben Shen (2009) Characterization of the SgcF epoxide hydrolase supporting a (R)-vicinal diol intermediate for enediyne antitumor antibiotic C-1027 biosynthesis. Journal of American Chemical Society 131: 16410-16417.

·Si-Kyu Lim, Jianhua Ju, Emmanuel Zazopoulos, Hui Jiang, Jeong-Woo Seo, Yihua Chen, Zhiyang Feng, Scott R. Rajski, Chris M. Farnet, and Ben Shen (2009) Iso-migrastatin, migrastatin, and dorrigocin production in Streptomyces platensis NRRL 18993 is governed by a single biosynthetic machinery featuring an acyltransferase-less type I polyketide synthase. The Journal of Biological Chemistry 284:29746-29756.

·Uwe Rix, Chenchen Wang, Yihua Chen, Fredilyn M. Lipata, Lily L. Remsing Rix, Lisa M. Greenwell, Leo C. Vining, Keqian Yang, and Jürgen Rohr (2005) The oxidative ring cleavage in jadomycin biosynthesis: a multistep oxygenation cascade in a biosynthetic black box. ChemBioChem 6: 1-8.

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